mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTTGGTTGGAGGGACTAAA TAGTCCCTAGTTTCCAAACACC TACTAAGGTGGTGTTTGGTTGGAGGGACTAAAGTGGGGTTAAACTTTAGTCCCTCTCAGGACTTATGTTTTTATGAGAGGGACTAAATTTAGTCCCTAGTTTCCAAACACCCCCTAAAG GCTAGCAGCTCGAGTGGTACGCCCATCTCGCGCGCGGGTGGTCCATCCACCGGTGGCGCGCGGCGCCGACGCCGACGCCGACGCCGTGGGCGCGCGCGCTGCGCTGCGCTCGGAGTGGCATTGGCACAGCACGCAGGAGGCAGGGCAGGCCAGATCGATCCCACCACGGCCGCGTGCGACAGTAGCAGCAGCCGTGCCATGGGCAGGGTAACGTGACGCCCAGTGACAATCACCGTCAAAAACAGGGCAGGGGGCAGCAAGCCGACGGCCGGCATAGGCAGTTTGCTGACCGTGACTGCAGAGGCGTACCTGGAGGCTGGAGGAGCCAACTGATGATGGTACTAAGGTGGTGTTTGGTTGGAGGGACTAAAGTGGGGTTAAACTTTAGTCCCTCTCAGGACTTATGTTTTTATGAGAGGGACTAAATTTAGTCCCTAGTTTCCAAACACCCCCTAAAGAGACTGGGTTTTTATTTTTATTTGTTCGATCGCGTTTGTGTGAATGTGTGATCAGATCGAACTTTAAAAGGAAAAAAAAAGGAGCTCCCGTTTGCCGGTGATGTGGTCAAAATAAAAAAAAAAATAAAAAAA 4 1 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR1122 0.0000004 100 -50.3 .....(((.(((((((((....((((((((((............((((((((((((((((((....))))...)))))))))))))))))))))))).....))))))))).))).... (-50.3)