mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATACTCCATCCGTCCGAAA CCGGATGGAGGGAGTATA TATACTCCATCCGTCCGAAAATACTTGTCCTAGAAATAAATAAAATGGGTGTATTTATAACTAAAATAATTCTACATACATCTATTTTTAAGACAAGTATTTCCGGATGGAGGGAGTATA 2 0 5' arm Hordeum_vulgare micropc MIR1122 1e-62 tae-MIR1135 0.0000001 -48.46 ((((((((.((((((((.(((((((((((.((....))...(((((((((((((.((...............)).)))))))))))))...))))))))))).)))))))).)))))))) (-48.46)