mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCAGTTGTTGCCTCATGCTT GCTTGAGACAGCAACTGCACA AAGCTTGAGACAGCAACTGCACAACTTGCAAGAAAGTCACGATTATGAAGACCCATAGATTTTGTAACTTCCTTGAAAGTAATGCAGTTGTTGCCTCATGCTT 2 0 3' arm Hordeum_vulgare micropc MIR444 0.000000001 hvu-MIR444b 9e-54 -42.1 ((((.((((.(((((((((((..((((.((((.((((.(((((((((......)))))...)))).)))).)))).))))..))))))))))).)))).)))) (-42.10)