mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGGAACGGAGGGAGTA CTCCCTCCGTCTCAAAATA TACTCCCTCCGTCTCAAAATAACTGTCTCAACTTTGTACTAGCTCTAGTATAAAATTGTACTAAGCTTGAGACACTTATTTTGGAACGGAGGGAGTA 2 0 3' arm Hordeum_vulgare micropc MIR1122 5e-37 far-MIR1122 0.000005 -50.1 ((((((((((((..((((((((.(((((((..........((((.(((((((....)))))))))))))))))).))))))))..)))))))))))) (-50.10)