mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGCTAAAAAGTCAATGGTG CTATTGATCTTTTAACACATGT TACTATTGATCTTTTAACACATGTTTGACCGTTCATCTTATTCAAAAACTTTTGTAAAATATGTAAAACTATACGTATGCATAAAAGTATATTTAACAATGAATCAAATTATAGGAAAAAAAATAATAATTATTTAAATTTTTTGAATAAGACGAGCGGTCAAACATGTGCTAAAAAGTCAATGGTG 3 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR812 5e-57 osa-MIR806h 1e-41 -67.12 (((((((((..(((((.(((((((((((((((((.((((((((((((((((((((...(((((((......)))))))..))))))))...........(((((..((((((.............)))))))))))....)))))))))))).))))))))))))))))).)))))..))))))))) (-67.12)