mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGACCAGGCTTCATTCCC GAATGTTGTCTGGTTCAAT GGAATGTTGTCTGGTTCAATGTCTCATACACCTTGTGGTTTTGAGGATGATTTGTGCAAGGTTTTTCATTCCTCTCATCCGTGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCC 4 0 3' arm Oryza_sativa micropc mir-166 4e-53 osa-MIR166a 1e-49 -39.76 ((((((..(((((((((...(((((((..(((....)))...((((((((...............))).)))))......)))))))...)))))))))..)))))). (-39.76)