mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATGTTGATGATGATTA ATCTCATCTATTATTCTCT TGATCTCATCTATTATTCTCTCGCTTCGTGTTCCCAAAATACCCCTCCCCCGGAACCCGTATCTACGATAAAACCAGATAACATGGATACTACTGAAAACCCTAATTCGGATTCTCCGGTTTTGGATTCTGTAATGGAACCTGAGGACGAGAATGTTGATGATGATTA 2 2 3' arm Antirrhinum_majus micropc 100 100 -46.7 ((((((((((...(((((((...(((((.(((((.....(((...(((.(((((....(((((((.(.((........)).).)))))))..(((((........)))))....)))))....)))....)))..))))).)))))..)))))))..))))).))))) (-46.70)