mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCACAGGCTTTCTTGAACTG GTTCAAGAAAGTCCTTGGA TCCACAGGCTTTCTTGAACTGTGAACTCGTGTGTGCATGCTCCTCATATATTGTTCTAGATCCCATGCATGATGCATATCGATCGATCTGATCTGAATTAGGTCATCGATGCGCATCTGGATCCCCATCTTGTTGATAGTTCAAGAAAGTCCTTGGA 2 0 5' arm Oryza_sativa micropc MIR396 2e-84 osa-MIR396f 8e-86 -61.1 ((((..((((((((((((((((.(((..(((((((.........))))))).......(((((.......(((((.(((((((.((((((((....))))))))))))))).))))).)))))........))).))))))))))))))))..)))) (-61.10)