mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTCACAAAAAGGAT CCTTTTCGGGACGGAGGGAGTACA AATGCTAGTACGAAATTTTGAACTACTCCCTCCGTCACAAAAAGGATGTCTCAAGTTTGTTTGAATTTGGACGAATCTATATATTAAATAGTGTCTAGATACATCCAAGTTTAGACAAATTTGATACATCCTTTTCGGGACGGAGGGAGTACATGTTTGGACAGGTTGTGGTGAAACCG 2 0 5' arm Avena_sativa pmrd MIR1122 6e-72 osa-MIR1862a 0.0006 -82 .....((.(((((...((..((((((((((((((((.(.((((((((((.(((((((((((((((((((((.(.(((((.(((((....))))).))))).).))))))))))))))))))))).)))))))))).).)))))))))))))...)))..))....))))).))...... (-82.00)