mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACTCGACCCCCTGGTCGAG CGACCACGAGGTCGAGTGCC GAGACCACTCGACCCCCTGGTCGAGCAGAGGACATCACCACTTCACTTCACCACTCGACCACGAGGTCGAGTGCCCTC 2 0 5' arm Arabidopsis_thaliana pmrd MIR854 0.00006 100 -34.54 (((..(((((((((.(.((((((((..((((..............))))....)))))))).).)))))))))..))) (-34.54)