mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCACAGGCTTTCTTGAACTG GTTCAAGAAAGTCCTTGGAAA GCGGCCATGCTCTCCACAGGCTTTCTTGAACTGTCAACTCGCGCGCGCCAGCCATCCATGGCCTGCTGCGTTGATGGTTCAAGAAAGTCCTTGGAAAACATGCCCGC 2 0 5' arm Hordeum_vulgare pmrd MIR396 0.000000000006 far-MIR396 6e-18 -56.9 ((((.((((...((((..((((((((((((((((((((.((.(((.((((........)))).))))).))))))))))))))))))))..))))...)))).)))) (-56.90)