mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG GATTTTTCTCCTCCACGGTCCAGATCTGGGTGCAAGCTCTTTCTTGCGTTTAGATCTCTCCTTG TTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCTTGATCTATTACTAATTAGTTTCCTCTTCCTTCTGCTGCATGCAAGCCTGGAAATGTTTTGCAGATTTTTCTCCTCCACGGTCCAGATCTGGGTGCAAGCTCTTTCTTGCGTTTAGATCTCTCCTTGAGCTTGAACTTTTCAAGCTGTGATTTTATGACCACGGTGTTTTGTTTTCCCCTCAAGGTAATGAATGAAAGATTCAGGTTATGCTTTGTACTTTGCATGGACCTTTATTCCCTTGCCTTTGAGCTGTGGTGTCATTGTTCCTTCGTCTTTA 5 198 5' arm Hordeum_vulgare_subsp._Vulgare pmrd MIR159 0.000000005 hvu-MIR159b 2e-39 -80.64 ...((((.(((((((..((((((....((.(((........)))..))...((((....(((.......)))..))))......))))))...........(((((...(((((((..((((((......))))))..)))))))..))...(((((((.....))))))))))........(((((((..............((((((((((.((((((.......(((((((((..........)))).)))))))))))..))))).)))))))))))).......)))))))))))... (-80.64)