mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA CGGCACGAGGCCCAAGCTCTCTCCAGTCTCTTCTTCTTCCTCCTTCCTCCACCCACACGCCCACCAACACCTACCATTACCAAGCTCTCTCTCTCGATCTTGGCACCTCTCTCTCCGCGACTCCATGAGTAGGTAGCGTCATCCATCCGTTCATCCATAAACACAATGTGGATGGAGCGTTTTGAGGTCAGCATTGCGAGGGGGGCTCGTTTGTGAGTGTGGAGGTGGATGCATGGCTGACGCCGTGCGTGCAATGCAGCTTCTGGGTGTGGGGAGGTAGGTGAAGTGAAGGTTCGGCAGGAAGAGGTGAAAACAATGGGATATGCCTGGCTCCCTGTATGCCA 11 339 3' arm Hordeum_vulgare_subsp._Vulgare pmrd mir-160 0.00008 tae-MIR160 8e-17 -132 .((((.....((((..((((.(((.((((((((..((((..(((.(((((.....((((((((....(((((.((((..((((((..(((((((((......(((((((......(((.((((...)))).....))).........((((((((((((.......))))))).)))))....)))))..))....)))))))))...))))).)...))))))))).(((((((((....))))))))).............)))))))).))))).))).)))).)))))...))).)))))))((....))..))))...)))).(((.........))). (-132.00)