mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATACACTAGCACGGGTCAC GACCCGTTCTAGTGTATCAAG ATCTGATGCACAATTGTGACCCGTTCTAGTGTATCAAGCGATTTTCAGTCCATTGATTCCATGTTTTAAGATAATTTTGAGAGTTCTCATATCTTGATATCTTGATCTGAAATTCTCTGATACACTAGCACGGGTCACCGTTGTAAGTCACGT 1 0 3' arm Lotus_japonicus pmrd 100 mtr-MIR2199 0.000002 -62.2 ...((((..(((((.(((((((((.(((((((((((.(.((.((((((..((..(((........((((((((....((((....)))))))))))).))).))..)))))).)).)))))))))))).))))))))).)))))..))))... (-62.20)