mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGAGGATTAGGTAAAACAAC TGTCTTACCCATTCCTCCCAT AAAGTTGCTATTGCAATTGTTGTCTTACCCATTCCTCCCATCCCATAAATCTATTATATGTACTCCATCATCATATGGATCCACTCTTGTCTTATGATAATAGAGTCGCATGATAGGAATCTTGGATCGGAGGATTAGGTAAAACAACTATTGCATTAGGCTTT 5 0 3' arm Medicago_truncatula pmrd 100 mtr-MIR1510a 6e-90 -58.3 (((((..(((.((((((.(((((.(((((...((((((.((((......((((((((.((.((((.((.((((((.((((........)))))))))).)).)))))).))))))))......)))).))))))...))))).))))).)))))).)))))))) (-58.30)