mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GACATGAATGCAGAACTGGAA CCAGTTCTGCGTTCATGTCCC TTCACCAACTTTCCAGTTCTGCGTTCATGTCCCCTGCAGCTTGACTTTAGGGGAAATCGAGCAACAAGGGACATGAATGCAGAACTGGAAAGATGGTCTGAG 0 0 3' arm Medicago_truncatula pmrd 100 mtr-MIR2086 4e-53 -61.9 ...((((.(((((((((((((((((((((((((.((..((((((.(((....))).))))))..)).))))))))))))))))))))))))).))))..... (-61.90)