mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAAGTAAAGAACCGGCTGCAG GCAGTCGGTTTCTTACTTCGG GCTTGATGAAAACTGCTCTTGACACATATGATAGAGCTAAAAAACATATGTAAAAGACGAAAATGCCCATGTAGCAGTTTACTACCGAAGTAAAGAACCGGCTGCAGTTAACTGCTGAAGTGTGAAGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTCGTCGGCAGTTAACTGCAGTCGGTTTCTTACTTCGGTAGTTAACCGTTGCAGGGGCATTTTCGTCATTTACATGTGTTTTTCAGCCCTATCATATGTGTCAACAGCAATTTTCTAGC 2 0 5' arm Medicago_truncatula pmrd 100 mtr-MIR2087 2e-112 -159.16 (((....(((((.((((.((((((((((((((((.(((.(((((((((((((((.(((((((((((((.((((((.(((.(((((((((((((..(((((((((((((((((((((((.....((((...............))))....)))))))))))))))))))))))..))))))))))))).))).)))))).))))))))))))).))))))))))))))).))).)))))))))))))))).)))).))))).))) (-159.16)