mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAAGGGAGGTGTGGAGTAG ACTCCCTACTTTCCTTTGATT TTTATTTTTTTTACACTAAGATACTCCCTACTTTCCTTTGATTGGAAATAAAGAGAGACAAAAAGGTAAATTTAATTTCTCTTCTTATGTCAATCAAAGGGAGGTGTGGAGTAGGGTGTAAAAAGTAAA 2 0 3' arm Medicago_truncatula pmrd 100 mtr-MIR2119 5e-62 -50.8 ......(((((((((((....((((((.(((((((((((((((((..((((..(((((...(((......)))....)))))..)))).))))))))))))))))).)))))).))))))))))).... (-50.80)