mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCAC GCTCACTTCTCTCTCTGTCACC GGAGGGTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGTGGTTGTTTCCTTGCATAAATGATGCCTATGCTTGGAGCTACGCGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCACCTCC 0 2 5' arm Oryza_sativa pmrd mir-156 2e-45 osa-MIR156a 5e-52 -57.8 (((((.((((((((((((((((((((.((((((....(((..(((((.........)))))..))))))))).)))))))).))))).)))))))))))) (-57.80)