mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGAGAGAGAGCAC GGCGCCCTTGAATGACAAGAGCTTGTCAAAGTCATGACAACGAAGAGTAGAGATGGTGCTTGGA TTGACAGAAGAGAGAGAGCACGCCGAATGTCCGGTGTTGCATCCAGGTTAGAAGTGATCATGGATGGCTTCTAGACCTTGATTGAGGACCCTCGGCAGTGGCGCCCTTGAATGACAAGAGCTTGTCAAAGTCATGACAACGAAGAGTAGAGATGGTGCTTGGAAGCTCTACACCAGGCAGATGCAGATGCCCATCAATGCCTTCTCCTCTCGTAGA 13 104 5' arm Persea_americana pmrd 100 far-MIR529 0.0002 -71.5 ...........(((((..((((((((..((((........(((.(((((((((((.(((...))).)))))).))))).)))...))))..))))).)))..((.((((.....)))).)).(((((......)))))..((((.(((..((((((((((((..........)))))))...((....)))))))..)))))))..)))))..... (-71.50)