mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATGCTTCTGTCATCA GGTGATGTTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATATGCAATGGACTCTGCATCCCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACTTTCA 1 1 5' arm Populus_trichocarpa pmrd 100 ptc-MIR156j 5e-52 -45.9 (((((......(((((((((((((((((((((((.((((..(((((........)))))..)).)).)))))))))))))).)))))))))))))).... (-45.90)