mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTCGTCTGACTCGAGA TGAGGATGTGGGGGAATGTCGTCTGACTCGAGACAACAGGTAAACTGAAGGAATGGCCGGAGTTTAAGAGTTCTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCATCCACA 4 0 3' arm Populus_trichocarpa pmrd mir-166 6e-49 ptc-MIR166m 6e-55 -48.2 ...(((((.(((((((((..(((((..((((((.(((...((((((...((.....))..))))))...))).))))))..)))))..))))))))))))))... (-48.20)