mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTGTGACAGCCTCACT AGGGAAAAAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTAGAGAAAGAAAGGACTAACCCTAGCTAGGTCATGCTGTGACAGCCTCACTCCTTCC 1 2 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR167_1 2e-48 ptc-MIR167b 1e-49 -44.4 ..((((..(((((.(((((((((((((((((.((..((((((............))))))..)).)))))))))))).).)))).)))))..)))) (-44.40)