mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GGTCATGCTCTGACAGCCTCACT AGGGAAAAGGTGAAGCTGCCAGCATGATCTATCTTTGGTTAGAGAAGGATAGAAGCGAAAGAACTAACCCTAGCTAGGTCATGCTCTGACAGCCTCACTCCTTCC 2 2 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR167_1 1e-53 ptc-MIR167d 6e-55 -40.16 ..((((..(((((.(((((.(((((((((((.((..((((((.............(....)..))))))..)).)))))))))))..).)))).)))))..)))) (-40.16)