mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGCCTTGCATCAACTGAAT GGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTCGGCGATTTGATTGCCAGATGGCTAAACACGATTGGCTGTGAGGCAAATTATAAAAAGAAAGAGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGA 3 0 5' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR168 4e-72 ptc-MIR168b 2e-73 -55.3 ..((((..(((((.((((((((((.(((((.(..((((..(....((((((((..((((((((......))))))))..))).)))))......).....))))..).))))).)))))))))).)))))..)))) (-55.30)