mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTCAGGACCCAATTCTCTTGGGTCCGG AGAACCCAAGGCTAATGGGTCCTGCGG GGTCCTGCGTCAGAACCCAAGGCTAATGGGTCCTGCGGAGGAACCAATTCTCACGGGTCCTGTGTCAGGACCCAATTCTCTTGGGTCCGGCGTTAGGACC 4 2 3' arm Populus_trichocarpa pmrd MIR474 0.00008 100 -57 (((((((((((.((.(((((((..(.(((((((((((.((((.((.........)).)))).)).))))))))).)..))))))))).)))).))))))) (-57.00)