mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG TCGGTTTCCTATTCGTACCCTG TTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCCTGATCCATCCATTCCATCCCCCCATGCTTGCTTTGTTTATTGGCTGTTCCTGAGTGAGATCTGAGGCTCATGGCTCTATGTAGCCATGGATTTTTTTTCCCTTTCTCCTAACTGCTGCTGCTGTTTCTCCAAGATTCAATAGGCTGTTCTGCCGTGCTTATCCGTGCTGGAGCTGGATGAAGCAAGCTGCTTTGCTGCTGCCCTCATCCTCATGCCCTGGATGATGGTGGTGTGGTGTGGTATCGGTACCCCGTACTTGCGTCGCTTTATTCCTATCTTTGCTGGTGAGGTGTTATGTCAGTACAGTAGTTTATGTCACCCTCGTTTATCTTGTTCTATATGCTTCGGTTTCCTATTCGTACCCTG 7 3 5' arm Sorghum_propinquum pmrd MIR159 0.0000000004 ssp-MIR159a 0.00000000000002 -108.7 ...((..(((((((((((..((((.(((((((((((((.(((((.......((((((((..((((..(((.(((...(((.(((....((((..(((((((......)))))))..))))......))).)))..))).)))..........((((...........(((......)))..((........)).)))).))))..)))))))).((......)).....((((((.........)))))).))))).)))).)))).)))))......(((((.(((((((((((((..((....))..)))))))))..)))).)))))...................................))))...))))))))..)))...)).. (-108.70)