mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGAGAGAGAGCAC GTTCAG TTGACAGAAGAGAGAGAGCACCACTTGAATCTGAGACTCCAGGAAAATAGTCTCCAGAAGGAACACTAGGATAACTGGTCCTGGTAGCTGAACCTTGCAAAACAAGCTCACTGGCAGCATTTTCAGAGTTATTCAGCCAAGGACGTTGAAGGAACTTCCCTGATGATTGATGATCCCATCCTTGTTCAG 16 0 5' arm Solanum_tuberosum pmrd 100 far-MIR529 0.0001 -45.4 ...............(((((...((((...(((((((((...((((((.((..((((..((...((((((((.....)))))))).((........))........))..))))..)))))))).)))))..)))).))))..((((..(((......)))))))...((((....))))..))))).. (-45.40)