mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAATCTTGATGATGCTGCAT GCAGCACCATCAAGATTCACA GTGCAGCACCATCAAGATTCACATAGAAAATATGGACTATGAAATGAAATATGCCCAATTTTTGAATACATGAGAATCTTGATGATGCTGCAT 2 0 3' arm Solanum_tuberosum pmrd mir-172 0.000005 sbi-MIR172d 0.0000003 -34 ((((((((.(((((((((((.(((.((((((.(((.((((........))).).)))))))))......))).))))))))))).)))))))) (-34.00)