mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCGCCGACGATGACGGAGGA CTTCAGTCCATGTCAGTGTCCT AGGGAGTTGATGGCGCCGACGATGACGGAGGAGAACCATACGGCGACGATGGCGCCGCCGGCGTACGTCAGCACGGTGGACTTGTTCTCGACGGCGTCCCACTTGGCTTTCAGGTCGTCGACGAGCTCGTCGCCGCTCGCGGCAGAGGTGTCATCGGAGGAGGCCTTCGCCCGGAGCAGAGAGAGCCGCGGTGTATCTTGGAGGCCAAGAGGGGAGAAGTTACGCCGTGGGAGGAGAACGGACCGCGGCGCGGCGGCGGCGCGGACGGGGAGGCGCGCTCCTGCTCCACCCAGAAGCGCCGTAGAGCACGCCGTTGTGGCCATGTTCTCACCTGCAAGCTCTTTCTACTCCTTCAGTCCATGTCAGTGTCCTCGTGCTCC CCGAGAGCGGCCGCCCTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCCCCTGAAAATAGTTAAGTCTTTTGCCTTGTTGAAAAAAAAAAAAAGCAAACCCTCTGATAAGCGTTCTCGAGATATTCATCCAACAAAAAAAAAATCCATACAACATTATTTTCTTTTACTCTGCCTCTGTACCAGCAATGCTCTTCTTCAAGGACTCCACGTCGTCGGCCAGCTCTTCCCTGCGTTCCTTGAAGAGGAGGTAGCGGTACACGAACCATCCGCTGTAGCCGAGCCCAACAGGCTCCATGATCTTGGGAAGCAGAGGCAGGGAGTTGATGGCGCCGACGATGACGGAGGAGAACCATACGGCGACGATGGCGCCGCCGGCGTACGTCAGCACGGTGGACTTGTTCTCGACGGCGTCCCACTTGGCTTTCAGGTCGTCGACGAGCTCGTCGCCGCTCGCGGCAGAGGTGTCATCGGAGGAGGCCTTCGCCCGGAGCAGAGAGAGCCGCGGTGTATCTTGGAGGCCAAGAGGGGAGAAGTTACGCCGTGGGAGGAGAACGGACCGCGGCGCGGCGGCGGCGCGGACGGGGAGGCGCGCTCCTGCTCCACCCAGAAGCGCCGTAGAGCACGCCGTTGTGGCCATGTTCTCACCTGCAAGCTCTTTCTACTCCTTCAGTCCATGTCAGTGTCCTCGTGCTCCAGTCGCGGACGCGTGGGTCGACGATATCCCGGGAA 3 1 5' arm Triticum_aestivum mirnest 100 100 -158.3 ..(((((.((.(((((.((((..((((((((((.(((.....((((((...(((((...))))).)))).))..)))((((((((((((.((((((((((.(((((((((((((.(((((.((.((((.((...((((..(((.(((((.((.......)).))))).)))..)))).))..)))))))))))...))))))))))))).)))........))))))))))).(((((((..((((((((((((.(((((((.....(((.((.((......)).)).)))....)))))))...)).)).))))))))...)))))))....))))).))).....))))))).)))..)))).))))).))..))))) (-158.3)