mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAGTTGCTGTCTCAAGCTCT GGTTTAGGGCAGAAACTTACT ACTTTGTAATTCTCGATGTCAGACCATAAGCATAGTTCAAACAGGTATCTTAAAGTTGCTGTCTCAAGCTCTTGGGTTTAGGGCAGAAACTTACTTTTACATTGNTGCCTACTTATCTTTTTTGTGTCTTTTATCAACCCGAA ACAACTTTGTAATTCTCGATGTCAGACCATAAGCATAGTTCAAACAGGTATCTTAAAGTTGCTGTCTCAAGCTCTTGGGTTTAGGGCAGAAACTTACTTTTACATTGNTGCCTACTTATCTTTTTTGTGTCTTTTATCAACCCGAAATGATAGCTGAAGCAAATTGTGTATCAATGATGATGTATTGAATCGACAGCACTATGATGAGTACAATGCACAATTATATAATAACTGGAGATATAATATATGTTGCTGATGCAATAGCCAACATAAATTTAGAAGTCTGCTTAGTAGGACCTAAACGGCTAACAGTGATCAAATCCTCTCCAATGATGCCTAAAAAAAATGTCAAAAGTTTGTTTTCATATTGTGCTGCTTCATACAATGAAATTTTATATTTCAATCTGGGAAAGTT 5 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest 100 100 -30.3 ..............((((..((((((.(((...(((.((..((((((.....(((((.((((((.(((((....))))).)))))).))))).....))).))).))...)))...)))...)).))))..))))........ (-30.3)