mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATCTACTCCCTCCGTCCCAT GGGATGAAGGGAGTAGATATG AGCTTTAATAAAATCTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAACATTTTTGCTTGAAAAACGTTCTTGTATTATGGGATGAAGGGAGTAGATATGTACTCTTG TGGTGGCTGGTAAATGACATGAGTATTTAGCTTTAATAAAATCTACTCCCTCCGTCCCATAATATAAGAACATTTTTGCTTGAAAAACGTTCTTGTATTATGGGATGAAGGGAGTAGATATGTACTCTTGTGGATGAGGCTGGTACTAAATGTGCATTGAATTTACCAGCATTGGTTAATATTGGTTTTACTGTCGAAAAAAAAAA 2 0 5' arm Triticum_aestivum mirnest MIR1122 0.000000000006 tae-MIR1120 0.0000000000003 -46.1 ............(((((((((((.(((((((((((((((((((.(((((.....))))).))))))))))))))))))).)))))))))))........... (-46.1)