mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAGCTTTAGTCGCGGTTGGC CAGCCGCGACTAAAGGCCTT ACAAACCGCGACTAAAAGGGAGGAGCTTTAGTCGCGGTTGGCCTGGCCAGCCGCGACTAAAGGCCTTTGGGCACCTTTAGTCGCG TAGCGTGGTCGCGGCCGAGGTACCGGTTCGTGGCACGAACCGGGACTAAAGGTCTCAACCCCATTAGTTCCGGTTCGTGCCACAAACCGCGACTAAAAGGGAGGAGCTTTAGTCGCGGTTGGCCTGGCCAGCCGCGACTAAAGGCCTTTGGGCACCTTTAGTCGCGGTTGGATTATTCTAGAATATAAGTGTTACTAAATGTTTAACGGGGTTCCCCCTGTTAAATTTGGATGTAACTTTTCGAGANNATGATTTTTCATATAAAAAACTTTTTCATCCGAGTTAGTATGCAAAAGTTATGCCCATTTTTACAAATTTCNNNGAGATTTTGCAAATAAAGTCAAAATTTCACATTTGCAAATTTTNNCACAANTNTACCACATATCACATGANNAACTTATTCTCTTTTATTTTTTTGANANNTCCATTATTTCCTTTTATTTNNNNNNNAACTGA 1 1 5' arm Triticum_aestivum mirnest 100 tae-MIR1117 0.0000000000003 -44.5 ......((((((((((.((((((..(((((((((((((((((...))))))))))))))))).))))......)))))))))))) (-44.5)