mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTGACGCATGTTGTTTTTC GGAATGACCATGCCACAAGTAA TGAAGAGATCATCAGACCAAACTTATCCATTCGAGAAGGAATTGAAATTATCGTTTCTGGAGGAATGACCATGCCACAAGTAATTGCATCGCTAGATCCCATCCCAAGAAAGAGCCAGAGCATCCGCCTAAATAGAATAATGACATGAGGATGTGTGAGTCATCAAAGCAAGGGTCGCAAATGGGTGGATGGGACTCCAGTGCTGGTCTGTTTGTGCTGTTCGTTTCTTACGTGTAAAATGTCAAGGTTGGATACGGGAACGTGATGACCAAGCTGGACGGAAGCATCGTACCGATGGCCTGGAATGCTGTTATGTGACGCATGTTGTTTTTCTCTGTTTGCTGACTGGTCCAAAGTGTTAACTTCGATGCACCGGTGGTGTACAACTAGT ACGCATTCGGATTTATAACATCAACTGTTGTCCTTCAGACAGACAAAGGTGATGAGGAATTGTGTAGTGTTTATGTGCCAACAAATCATCTATATATTGGTGATATATTTCTGCTGAACTCTGAAGAGATCATCAGACCAAACTTATCCATTCGAGAAGGAATTGAAATTATCGTTTCTGGAGGAATGACCATGCCACAAGTAATTGCATCGCTAGATCCCATCCCAAGAAAGAGCCAGAGCATCCGCCTAAATAGAATAATGACATGAGGATGTGTGAGTCATCAAAGCAAGGGTCGCAAATGGGTGGATGGGACTCCAGTGCTGGTCTGTTTGTGCTGTTCGTTTCTTACGTGTAAAATGTCAAGGTTGGATACGGGAACGTGATGACCAAGCTGGACGGAAGCATCGTACCGATGGCCTGGAATGCTGTTATGTGACGCATGTTGTTTTTCTCTGTTTGCTGACTGGTCCAAAGTGTTAACTTCGATGCACCGGTGGTGTACAACTAGTGT 3 1 3' arm Triticum_aestivum mirnest 100 100 -93.5 ....((.....))........(((........)))..((((.(((.....))).)))).((((((((((.((((..((.(((((.((((..((((.(((..(((((.......((....)).((((((((..........((((.((..(((((....).))))....))...))))....))))))))))))).((((((..(((((.((((.((.((((((..((((((((.....)))).)))).)))))))).)))).....))))).)))))).)))..(((((...)))))..)))).)))).))))).))..))))))))))))))..(((.((((.((((((.((((((....))))...)).)))))))))).)))...... (-93.5)