mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAGTGTATTGTTAGTTAG ACTAACTACACTGCCACA CTAGTGCTGTGTGTGATGATTAGGCAGTGTATTGTTAGTTAGCTGCTCTTCATACACCAGCAACTAACTACACTGCCACATTAGCACATCACTGTGTC GTGCCCTGAAAGCCGTCTAAATGAAGATCTATGAAAAGAAATAGGAGCAAAGTTGTGAAGCTCTGCAGAGTTAGTGTCCTCCTAGTGCTGTGTGTGATGATTAGGCAGTGTATTGTTAGTTAGCTGCTCTTCATACACCAGCAACTAACTACACTGCCACATTAGCACATCACTGTGTCACTATTGAGACAGGAATGTAAAGACTGTTATTGCAAACACCTCATCAGGTCCATCAGCTGGTGTGGAGCCCAGTGCCAGCTGAAAGAAGGTGTGCTAGGTTATGCAAAGTGATGGAATTGATAAAAATATGTTTAACTGTGTTTTACACAATTATGCAGCTAATCCAATTGATTTCTAACAATTCTGCTAACTTAAGTCAGTAACTGTAGTAAAAAGCTTCAGGTTTGGGGTCCCATGTGGATGTTTTCTTACGTCTGTTAGTCTTGGAACATTCATCAAAATGAACGACAGTGGAACCACAGATGTGGTTTGGGCAACTCTCCACTTTTTCTTCACTGCTGGTATGCCAAAACTTCAGGGTGCACCACGGGTGTGTTCGGTTCCCAGTGCAGGCAAAAGCTCCACTTTAAACTTGGGGAAACTGGGCGGAAAACAACAAATGGTTTGTTGAATTTTGGTTGGAAAACCTTACCTTTTCTTTCGGAATGGGCTTGAAAAAC 2 2 5' arm Gallus_gallus mirnest mir-449 1e-43 mml-mir-449a 0.0003 -34.7 .(((((.(((((.(((((....(((((((((..(((((((.((((............)))))))))))))))))))).)))))))))).))))).... (-34.7)