mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGGCATGGTGGTGGGGGCTC GCTCACCATCGCCATGCCCGTG CAAGACCTGGTCGGGCATGGTGGTGGGGGCTCTGTGTGCGCTGGCCGGGGTGCTCACCATCGCCATGCCCGTGCCCGTCAT CTTGATTTTTGCNNNCATGATCTACTATGCCGAGCGGATCGGAGCNNAGACGTCTGACTCCAGCGGGAGCGACCCGACTCACTTTAAGAACATCCCCATCGGGTTCTGGTGGGCCGTGGTCACGATGACGACGCTGGGCTATGGTGATATGTACCCCAAGACCTGGTCGGGCATGGTGGTGGGGGCTCTGTGTGCGCTGGCCGGGGTGCTCACCATCGCCATGCCCGTGCCCGTCATTGTCAATAACTTTGGGATGTACTATTCGTTGGCCATGGCCAAGCAGAAGCTGCCAAAGAAGAAGAAAAAGCATATACCCCGTCCGGCCCCGATGGACTCCCCCACCTACTGCAAATCTGAGGAGAACTCCCCCCGCAACAGCACCCAGAGCGACACTTGCCCCTTGGCGGTAGAGGAAGGGGTGGCTGAGCGGAAGCGGTCAGACTCCAAGCAGAACGGTGAGNNNNACGTGGTGCTGTCAGACGAGGAGCAGCCGCTGTCCCCATCCGACGAGGAGAAGCGNNNCATGCGGCGCTCCAGCACCCGGG 1 1 5' arm Gallus_gallus mirnest K_chan_RES 4e-37 100 -41.5 ...(((..((((((((((((((((((((((.((.((.((....)))).)).)))).))))))))))))))).))).))).. (-41.5)