mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTGTCCCGGCCTG GGTGGGGATTTGTTGCATTACT GCCTTGCGCTGGTTCCTCCGTGGGTGGGGATTTGTTGCATTACTTGTAGCTGTGTGTAGAGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTGGAGGAAAGGAGGACTGG TGCTCATTGACCACCGGTCACAGCGTTGCATTTGTTTCGTTGAAGGCAATTGCTCAGGAAGCAGCTGTGTCCTAGCAGTATCAAAGTGCTCATAGTGCAGGTAGCTTGGCATTGGACCTACTGTAATGTGGGCACTTACAGTACTGTTAGATAAAGTGCGTCCCGGCTCGGGGCAGCTTCTGGAGAAGATGCCTTCCGGAGAGGTGCTGCTCACAGTCAGTTTTGCAGGTTTGCATCCCAGCTTGCTAAAATTGCTGTGCAAATCCATGCAAAACTGACTGTGGTGGTGGTGAATAGCGGGGTTAGAAGCTTTCTTCCCCTCTTGCTGTGAAGATCCGAAGATGCCTTGCGCTGGTTCCTCCGTGGGTGGGGATTTGTTGCATTACTTGTAGCTGTGTGTAGAGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTGGAGGAAAGGAGGACTGGTCTTCAGGCTGCTCTGCTTGGTGGTTGTCAGCACGGTAAGCTTTGTTTGCTGTTGTCGGGTGGATCACGATGCAATTTTGATTAGTTTAGTAGGAGAAAAATTGCACGGTATCCATCTGTAAACCGCAAGACCTTCATCCGCTGACACAGCTTTGTCAGTGGGCAGCTCTCATGGTGTCGTGGCCGACCTAAAGGGGTGGGAAGGAAGAAAGCTCCAGATCCTGGGGTTTGTCTGCCCGGATCCTGAGGGTTGTCTGCTATTTCAAAAGGGGGAAAGCCACCTGGGACAGCCTGCAGGCATGCAGGGAAGCCCATCGGGGGAGTGCTTCTGTGATAACCATGGAATAACGTGGCTGGACTTAAGCAATTAAGAGAAGT 4 1 3' arm Gallus_gallus mirnest mir-92 3e-32 tgu-mir-92-2 3e-35 -37.8 ((...)).((..(((((((((((((.(((((..((.(((.(((((...((...))...))))).)))))..))))).))))))))))))).))........ (-37.8)