mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGTGCATCTAGTGCAGTT CTGCCCTAAATGCTCCTTCTGGC TGGTCCTTGTGTTAAGGTGCATCTAGTGCAGTTAGTGACGTAGCGTAGAATCTACTGCCCTAAATGCTCCTTCTGGCACAAGCTGC ATGCGGCGCTGGAGCACGACGGGAGCGGTGCGGTGCTGCCCTACTCGTGGTCCTTGTGTTAAGGTGCATCTAGTGCAGTTAGTGACGTAGCGTAGAATCTACTGCCCTAAATGCTCCTTCTGGCACAAGCTGCTGCCTGCACGCCATCCCTCTGCTCATTGACCACCGTGTCACAGCGTTGCATTTTGTTTCGTTGAAGGCAATTGCTCAGGAAGCAGCTGTGTCCTAGCAGTATCAAAGTGCTCATAGTGCAGGTAGCTTGGCATTGGACCTACTGTAATGTGGGCACTTACAGTACTGTTAGATAAAGTGCGTCCCGGCTCGGGGCAGCTTCTGGAGAAGATGCCTTCCGGAGAGGTGCTGCTCACAGTCAGTTTTGCAGGTTTGCATCCCAGCTTGCTAAAATTGCTGTGCAAATCCATGCAAAACTGACTGTGGTGGTGGTGAATAGCGGGGTTAGAAGCTTTCTTCCCCTCTTGCTGTGAAGATCCGAAGATGCCTTGCGCTGGTTCCTCCGTGGGTGGGGATTTGTTGCATTACTTGTAGCTGTGTGTAGAGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTGGAGGAAAGGAGGACTGGTCTTCAGGCTGCTCTGCTTGGTGGTTGTCAGCACGGTAAGCTTTGTTTGCTGTTGTCGGGTGGATCACGATGCAATTTTGATTAGTTTAGTAGGAGAAAAATTGCACGGTATCCATCTGTAAAACCGCAAGACC 4 2 5' arm Gallus_gallus mirnest 100 gga-mir-18b 2e-41 -27.4 .....((((((((((((.((((.(((.(((((..((.(((...)))...))..))))).))).)))).))))..)))))))).... (-27.4)