mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTGTGTGTATTTTCTTTTA ATGGAAAATATGAAATATAA TCTTATATTGTGTGTGTGTATTTTCTTTTATTTGTGTGTGTATTTTCTTTTTATAGAAAATAGATATTCAATATGGATGGAAAATATGAAATATAATTGGA CCTCAGTGTTTTTTCTGTGGCCTAGCTCTAAGCAGCTCCCTCACAATATATTGATTATAGATGCACTCTTTGTTCAATATAGTGTTTTTTACTGCTGTTCTGAAGCACCTACTATTTTACATCCACTGTCAGGAAATGTCAGGTATGTAAATCATGCTTTGGGATTCAACTGGAGTGGCAAGGGAGTCTAAAATATGTAGTACTCATTACACAGTTTCCATACTGTCCAATGAAAAAAAATTAAGTTTGTGGGAAAGCTCATAGTCAAGGTTAGCTTTTTCATGCTGACAAGATCAAAATAAGAATGTATAAGCACATTTGTTTTTGCCATTCTTATATTGTGTGTGTGTATTTTCTTTTATTTGTGTGTGTATTTTCTTTTTATAGAAAATAGATATTCAATATGGATGGAAAATATGAAATATAATTGGACCTAAATAATAGTACTGGTATAGGAGGGAAAGCTGCAAAACCATTGATGATCTACAGATATCCAATGCAGGATAGCTTTAATGCTATAATCCAGTTTTAATGCTATAATCCAGCTTTAGTTAAAGCTGGATTAGCTTTAAATGGTTGCATTTTATATAAATCCTGAACACATTTAGAGATATTGCATTAATTGAGCACGGTTTTATCTAAACTTTAAGACAAACAAACAAACAAAAAAAGAATATCAGATTACCTTTCCTGGTTTCCATTCCACCTAC 4 1 5' arm Gallus_gallus mirnest 100 100 -24.1 (((...(((((((...((((((((((.((..(((.((((.((((((((......)))))))).)))).)))....)).))))))))))..))))))).))) (-24.1)