mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAACTGCATACAAATTGG AATTTGTATGGAGTGGGAACG AAAGTTAACTCAAATTTGTATGGAGTGGGAACGTTTGCCGCTAGGGGCGCTGTTCCAACTGCATACAAATTGGAGTTATGGC ATTCCGGGCAAAAGAAAATAACGTGATTGCATCTTGTAGTCGGCGCGTCGAGAACATCTGGGTCTAGTGACTTAGAATTATTTTCTGTACCACGATGTACAAGCCAGAAAGGAATAGTTTCAACGTAACCATACAATAAACAGTGAGCTTAGTGAAAGTTTTTTAACGTTCTCGATAACGTAAAAGTTAACTCAAATTTGTATGGAGTGGGAACGTTTGCCGCTAGGGGCGCTGTTCCAACTGCATACAAATTGGAGTTATGGCTATTTATGGCACCATTTCGATAAAGCGGCACAACACGAGAACCCTCTCATCGTTTCCACCTACCACCGGGTCGCGTTACCGATCCGGTGTAAGATTCTGCGAAGATCCGGTGGTCGGTTCGTGTAAGCAACATCGTCAGGTTAGAGCCCCGTGAGTTCACCTACTAATTCGGGGAATCTAAAATAAAC 3 0 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 4e-28 bmo-mir-2807d 7e-17 -32.8 .....((((((.((((((((((.(((.((((((..((((......)))).)))))).))).)))))))))).)))))).... (-32.8)