mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAACTGCATACAAATTGG TATTTGTATGGAATGGGATC TAGGAGCTCAGTGTGCTTGGTGCGAGTTTTTTAATGTTCTCGATAGCGTGGAGGTTAGCTCATATTTGTATGGAATGGGATCGTTTGCGTACGTTTGCCGCTAGGGACGCTGTTCCAACTGCATACAAATTGGGGTTCACTTATGCGCTGTCGAGAACGTTAAGAAACTCTCACTAAGCACACTGTTCGCAA CGAATTCTTCTGCGAAGCACGGCTCTCGCTTGTGTTAAGAAATTCTCTCAGGTTGTGCCCCTGAGCTCACCTACCAGTCACAGCGTAGTTGGTATAGCCCCTTAGACTACCAACGAATAAGTAGGGGAAAAAATAATAAAAAAATTAACAGGTACGATACGCTTGTTTTTAGTTTACGTGATAAAAACTGTCCGTACACGTACCACGGGATCCGCATTATACTCGCAAGTATCCTTTAAAATAATTGAGCGTTAGGAGCTCAGTGTGCTTGGTGCGAGTTTTTTAATGTTCTCGATAGCGTGGAGGTTAGCTCATATTTGTATGGAATGGGATCGTTTGCGTACGTTTGCCGCTAGGGACGCTGTTCCAACTGCATACAAATTGGGGTTCACTTATGCGCTGTCGAGAACGTTAAGAAACTCTCACTAAGCACACTGTTCGCAAGTGAATTAATGGAGTTAATAGAGCGGACTGTTTAAAAAAAAGTACATACATTAATCTTCAAGTGATGCCTTAAAATACGTATTATAGGTACGAATGAATGGTCTTTTGCCTTAGACGTGATTAATTGATGGAAATCGTCTGATCAACAAAGACTGATGCGTAAAGGTTGTAAGAACGGTTGATATGATAAGGATGTAA 5 1 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 2e-31 bmo-mir-2807b 0.000000000000003 -89.9 .....((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((.((((.(((((..(((((((((...((((((.....((((................)))).))))))....)))))))))..))))).)))).))))))))))))))))))))))))))).))))))))))))))...)).. (-89.9)