mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCAACTGCATACAAATTCG GATTTGTATGGAGTTCGAGCG AGTNGCAGTTTGTTAACCTTCTCGATAGCCTAAAAGTTAGTTCAGATTTGTATGGAGTTCGAGCGTTTGCCGCTAGGGGCGCTGTTCCAACTGCATACAAATTCGAGTTAAATTTACGTTATCGAGAACGTTAAATAACTCGCCCTAAGCACAC AGTNGCAGTTTGTTAACCTTCTCGATAGCCTAAAAGTTAGTTCAGATTTGTATGGAGTTCGAGCGTTTGCCGCTAGGGGCGCTGTTCCAACTGCATACAAATTCGAGTTAAATTTACGTTATCGAGAACGTTAAATAACTCGCCCTAAGCACACAGAACTCGGGCACAGTAGAGAAGTTTTCGTGGTCAACCCTACAACCGAACTCCCGGCGCCATCCCTAGGACACCCGACNGANGGATCGTCAAGGTCGTCGTATCGATGACTCTGCGTCGCCGTCTCGCTATACCAGACAAGCCGCCCCAGGTGATGCTCCAGGTGTTCCGAATTACCCCACCGGACTAGAACTAGCCTGCTTGGTCTGAATGCGATACACCGCCAACTGATTACACAGTAGATAGTGATGGCCGCAGTTTCCCTCAGAGATCGAATCAGAAATGAGGAGATTCACAGAAGATGCTTGATAGCAGATATAGAAAGATTGCGAGGTAGAACTGGCATTAGGCAGGACATTTTGCTCCTAGAACAGATGGCTATTCGAGTCAAAAAGTTCTTGATTGGCGACCGCGCACCGAAAACAATTNNAGCNATTCAAAACTGTTCAGTACGATATTTGATTTAATAGTACTCGACGAGCTGTGGTCATATTACATACCCGATCCTGTAGACCGCATGGTAAACAGCCGACGTCGCCC 3 0 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 7e-25 bmo-mir-2807d 4e-26 -53.4 ((..((((((..(((((.(((((((((((.((((..(((((((.((((((((((.((((.(((((..((((......)))).))))).)))).)))))))))).))))))).)))).))))))))))).)))))..)))).)).))........ (-53.4)