mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACCTGCATACAAAATTGGGT CTCATATTTGTATGGAGTGGG AGTGCGAGTTTTTCAACATTCTCCATAGCGCAAAAGTTAGCTCATATTTGTATGGAGTGGGATCGTTTGCCTACGTTTGCCGTTAAGGGCGCTGTTCCCACCTGCATACAAAATTGGGTAACCCTTACGCTATCGAGAACGCTAAAAAAATCGCAC TATTTCATTTCGTTTACGAATAAATAATTTCAAGCTGGAGTTACTCGCTTATTATTTATCGCGACTTGTATGCTTTTATTCTGTGCGAGTTCAATAATTGATTTTAGACTAAGATCCCGGGTGCCAGACTTAAACATCTCAACATAGCTTTGAATCAATGTATTATTTGTAACTATTCATCCACTACGCATTAACCCCGATCGTCCTACGGGCACGGCGCCGCGACGTCTCCAGTGTGCTTAGTGCGAGTTTTTCAACATTCTCCATAGCGCAAAAGTTAGCTCATATTTGTATGGAGTGGGATCGTTTGCCTACGTTTGCCGTTAAGGGCGCTGTTCCCACCTGCATACAAAATTGGGTAACCCTTACGCTATCGAGAACGCTAAAAAAATCGCACTA 4 2 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 1e-26 bmo-mir-2807d 0.000000000000002 -52.3 .((((((.(((((.....(((((.((((((.((..((((.((((..((((((((..((((((.((..((((((((.....)))...))))).)).))))))...))))))))..))))))))..)).)))))).))))).....))))).)))))) (-52.3)