mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACTGCATACAAAATTGGGT TCATATTTGTATGGAATGGG TGAATGTACAATGTGCTTAGTGCGAGTTTTTTAACGCTCTCGATAGCGCAAAAGTTTAAAGCTCATATTTGTATGGAATGGGATCGTTTGCCTACGTTTGCCGCTAGGGGCGCTGTTTCAACTGCATACAAAATTGGGTTAACTTTTACGCTATCGAGAACGTTAGAAGACTCGCACTAAGCACACAAAAAACGAACG AAACGAATCCACTANCCNAAAAACGCTTATACAACAACAAAAGAACCAAAACTACAACATATACTATTACACTGCATTCGTAACTAAATTCAATCTTATGTGTACACAATGTACGCATTTTTATTACTTTAAAGATTTCTTTACGTGCATAAATTTTGTATTAAACTAATCAAATCCCTGTCACACTGTGGCTAACGCTAAACTATATCAAATACACTTACTTCCATAAATTAGTTGCGTATCACCTATTGTACCTATGTATATGAGTTTAAGGTACTTGAATAATGTTCCGAGAATTATCAAAAACCGTACAGGGTTTCTCCATTGAATTATACGTGAATGTACAATGTGCTTAGTGCGAGTTTTTTAACGCTCTCGATAGCGCAAAAGTTTAAAGCTCATATTTGTATGGAATGGGATCGTTTGCCTACGTTTGCCGCTAGGGGCGCTGTTTCAACTGCATACAAAATTGGGTTAACTTTTACGCTATCGAGAACGTTAGAAGACTCGCACTAAGCACACAAAAAACGAACGGAAACACGTACTTAAATTAAGTATACAGGAGGGGCCTCAAGTGGCCTATTCAATCACTCTTCGGCCCAATTACGGCCTACTATTACGTGTACTATTAAATACTCCTTAGTGTTGAACGTAGCCACTCAGTGAAACGACTTTGTTAAACAATGTTAATGTATTTTATAATTTACTGTTATTAATAATCATTTATTGTGAAAATAATAAGTGTGCGTATGAATAGCAGAGGATGTTTTATACAATACAACGTTATTCTTCGCATTATTCTA 5 1 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2807 1e-39 bmo-mir-2807d 1e-26 -83.5 ...........(((((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((((...((((((..((((((((...((((((.((..((((..((.....))...)))))).))))))....))))))))..))))))))))))).))))))))))).)))))))))))))))))))))))))............. (-83.5)