mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCGGGAAAAAAGTAGGACAT GTTCTACTTTTCTCCCTTGGT AGTATGTGCACCGCGGGAAAAAAGTAGGACATCTCATTCCGCGTGTTTGTATGTAACACGCGGGAGGAAATGTTCTACTTTTCTCCCTTGGTGCACAATG TAACTGGCATAAAGTTGATTTTGTATGGACGAACACAAGTAATACTTCTTTTTCTCCTACCTACGCCGAAAGTTCGGTTTTCCTCCCGCTGTACAGGGAAGAAAGTGTAACTTTTCCTCCCTGGGTACTGACAAGTGCGCATGCGCGTTAGTGTCTACGTCTGCTCTCACGCACCTAAAATTCTCCGCCATTGTTGTGCTCGGGTAATTTGCAATATTGTGTTTAGTGTAAAAGTGAAATAAACAAAAGGCAATAAAATTTAATAGTGAAGTATTAAATTTTATTGCATTAAACAAAGATGAGTTCATCAGACAGTTCTTATTCAATTAGTAGTAGTTTATTTCAAAATTAAAAAACAGTTAAATTGATTTTTTATGAGGGCTCCGCCCCCCGTGCCCCCCGCCAGGGCTTCGCCCCTGGTCCCCGGCTCGGTACTCCACGAACTTTCGGCCTAGTAGGAGAAAAATTAGTATGTGCACCGCGGGAAAAAAGTAGGACATCTCATTCCGCGTGTTTGTATGTAACACGCGGGAGGAAATGTTCTACTTTTCTCCCTTGGTGCACAATGTACTATTTTGTATA 2 0 5' arm Bombyx_mori mirnest 100 bmo-mir-2775b 9e-20 -57.2 ....(((((((((.((((.(((((((((((((.((.(((((((((((.......))))))))))).)).))))))))))))).)))).)))))))))... (-57.2)