mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCGGTGGAAGATCTTCCCTT GGGACCGTCGGTCTACCGAGCA ACATGAAGTGTAATAAATAAATGGGACCGTCGGTCTACCGAGCAATATCACCCGCTCGGTGGAAGATCTTCCCTTTGTCGTTTAAGCCATCCTA TGGATCCCCGGGCTGAGGATCGAATTCTGAAATGGTAAGTAAATGTGGGAATATTTCAATTTAAGGTGTTTTAATTCGATCACGTACTTCTGTTTGAAATTTTATTTGGGACTTTAACTGTAAGATATCGGATTTAATACGTCATTACTAAATGTTACACATACTTTCACTTGGGACTTACATAGTTCAAGACAGATGAAACCGCCCCACTCCCTCCGCTGATAATAATAATTTGCACCTACCACTATCTACTCTGCACTACCTTGGGTTGACTGGTAGAGAATGCCTTAGGCATTAAGTCCGCCAATGTAAATTTTACATGAAGTGTAATAAATAAATGGGACCGTCGGTCTACCGAGCAATATCACCCGCTCGGTGGAAGATCTTCCCTTTGTCGTTTAAGCCATCCTAAAAAATAAATAATAATAATAATAATAATGGCATTTATGTACTCCACAATATACTCCAATAATTCAATATGAAATTTAATTATGGATTTTCGATCAGCGCCATGAGGTCACGCGCGACCCACGCGTTCCAGGAAACGTAGTA 4 1 3' arm Bombyx_mori mirnest mir-2774 2e-33 bmo-mir-2774b-1 1e-24 -28.4 ((((...))))..(((((.((.((((..(((..((((((((((..........)))))))))).)))..)))).))...))))).......... (-28.4)