mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGCATGTGTGTATAACTGT AGTTGTATGCATTTGTCGGTG GATTTCACTCTTAGTTGTATGCATTTGTCGGTGTGTGCATGTGTGTATAACTGTGTGTATAAC TTTTTTTCAGACATAAAATACGTGATTTTATTCTGGCATATACAGTGAAATAAATTACATCCCTCGTGTCACAGCTGGACATACAATGTACTCGGAGTACACAGGCTTGTACGCTCCGAAGTACAGCAAACTACTCCGGAGTATTCTTACAACCTCCGGAGTACAATAACGTACCGCAGAGTAGATAAAAGGGGCAGAACAACCACAGAGACGTTGTGAATAAACACAAAAAAACGAATAAAGTGTATGGTTTGTGTTGTACATTTGTTTCAGTTGCGTTGGAAGTTATCAACATACGGCTTGGCGATGTGTAATAGTTTATTTTCTGACACCCTGTAACCAGATTCACCAGTACACATACACAGAGAGAATTTATTATTGCAATCGCCCTTAACACATTTCTTTTCAGCATAACAAAGCTCGTAATATTGTCTTATGATAGAATTACTACACGATTGTTTATAGGAATTCATTTCGATTTCACTCTTAGTTGTATGCATTTGTCGGTGTGTGCATGTGTGTATAACTGTGTGTATAACTGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGTGTGTTTATATCAATGTGTGTGGGTGTTTCTGTATGTGTATCAGTGAGTATCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTATCACCGTGTGTATGCCCGTACACAGGGCACGGTACCTGATAGCAAGTGTACGACTATTACCATAATAGNCATATAATAATTATATAATTATAATATAGTTATAATATATGTAAAGTGAAATAA 5 0 3' arm Alvinella_pompejana mirnest 100 mmu-mir-467c 0.00004 -17.7 .((..(((...(((((((((((((.(((........))).))))))))))))).))).))... (-17.7)