mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCATTCCATACATCGTCTG GAGGTGTATGGAGTGAGAGA TTTCTCAACGTAGTATTTGGCAGAGGTGTATGGAGTGAGAGAAGGGAAAAACGCCTTTGCCGATCTCATCGGTTCTTTTTTTCCTCTCTCATTCCATACATCGTCTGACGAACGTAGCGTTGATCG GCTTCTTCAAAACCCTAATCTCGTCGCCATTTCTTTCTTCCTGCACCTCCAAACTTTCTATATAATAATAATAACAATAATAACTGGTTTTGCTCTTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATGGACAACGCTATGCTTCTTGTTCCTTTTTTCTTTTCATATCCTTTCTATCTGTGGACATACAAATTCTCTTCTCTTTCTCTGAACCAAAAGAGGCTGTGAAGATTGTTTGGGAGTGTGGACCCGATGCGTCGGTCGCCGTCAAACATTGCTCGCTGATGGCGAGGCAACGTTATCGCTTTTGTGATCTGTTGCAGCCATCGGTGGTGGTATTGTTTTTCGACTTCCGATCTGTCGTTGTGATAGATCTGAGCCTCTCTAATTCGCACCCGAACATTCCTCGGCGGCAATTTCTCAACGTAGTATTTGGCAGAGGTGTATGGAGTGAGAGAAGGGAAAAACGCCTTTGCCGATCTCATCGGTTCTTTTTTTCCTCTCTCATTCCATACATCGTCTGACGAACGTAGCGTTGATCGGTTCTGTATGGTTTTTGTTTTCCTTTGTATTCCCCCTGGAAACCCCTAATTTATTT 0 1 3' arm Vigna_unguiculata mirnest 100 vun-MIR1507a 1e-44 -52.1 ....(((((((.((.((((.((((((((((((((((((((((.((((((((.......((((((...))))))...)))))))))))))))))))))))))).)))).)))).)).)))))))... (-52.1)