mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCGGT CGATTTCTCTTGGTGTCCAGA TGACCGATTTCTCTTGGTGTCCAGAGTCTTAGTTTTTGTCTAGCACCATTTGAAATCGGTTATGATGTA TGACCGATTTCTCTTGGTGTCCAGAGTCTTAGTTTTTGTCTAGCACCATTTGAAATCGGTTATGATGTAGGGGGAAAAGCAACTACAGTGGAGAAGTCCTGTACAGTTTACTCTCAGATGAAGAATTCTGTATATGAAGTAATGTCTTTCATACAATAATATAACTACTTTTTGTACCCCTTGCAACATCTGTCTGAAAGGTCCACTGCCTTATGGAGTCAACTGTCTAACATTCTCTAATATGTTTCGCTAATAGTAGTTGAAGGTGATATTTTTGTTCTACTTCCAGATCTATTAACAGCATCTGGACACCAGAATTCATTGCAACCCCTACTAGTAAAGCAACGCCAGTGTTAATATGCAAACAGTATTGGCACAAAATTATACATGAAGACAGTGATGACTAGCCTATTACAAAGCCAAGACTCTAGTTTTGTGGTGCTCCAAACAGCTCCACAGTAGGAATTTGTGCATTGCCTTGTTCCTTTGTAAAATGAGTCATGCTTCTCTTGGAGGTTAGGATCTTGGAAGTTTGCACCACACTTAACACATCCCCATTCCCATTGATGCTTTTGAACCCAAATGAGGTTAGAATGCTGTTGGCCTTCTCTTGCCCATTTAAGCCCAGGAGATGGCTTGCTTTCACGAGGAAGTGATCCAGAATCACTTCCTTTCTGGGAGAAAAAAACCTGATCTCCTGAACATAAAATAAAATGGCACATGAAAGACAAAACATGGCAGAATTGTCCCTCATGCTCTAAGGAGCAACTGGAAGTAAATTAACTAGTTTCCATGCATTTCCCCCCAAAAAAT 4 1 3' arm Anolis_carolinensis mirnest mir-29 1e-21 tgu-mir-29a-2 6e-29 -22.3 .((((((((((...((((((..(((.............))).))))))...))))))))))........ (-22.3)