mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTATGCATATACTTCT AGGCATACGGCATGGGAAAA AATCTCTGCTCATTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACTTCTTTGAGAATCTGATCTAAAGAGGCATACGGCATGGGAAAATGGGGCAATTGAGGTATTC GATTTAGAATCCCAGGCAGCAAATCAGGTGGCTTGTCATGTCAACATCTGTGGAAGCTGCTGAGATTTTCATCAATCTCTGCTCATTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACTTCTTTGAGAATCTGATCTAAAGAGGCATACGGCATGGGAAAATGGGGCAATTGAGGTATTCCTCCACCATCCGACTCATCTTCATGAATCAGCTTTTGAAGGTATTGCCATTTGAAGTTAACACCTGCTAAATGGACTGGACAGTTTTTTTTGGGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTGCAAAGTGTATATTTCAGCCTTGCATGTCAGTACTTTTTGCATCTCACTTAGCTTTTATGTGAATGGCTATTTACAGATGCTTTCTTAAGTCTGCATAAATGTCTTCATATTGTCTGTAGACATATATTATGACTTGCATAGAAGACTGTCAATCCTTTTAACAGCTTCTTAGCAAGCAAAGTTCAGCAGGAGCAGTTTATCCTTCCATAAGCGCTTGCTGATATAAAACTAACAGCAATTGTTCATGTCTACCAATGCAACATAAATGTAATGGAGGAGAATGTTATGTTGTTATTTGCTCATCACAAGCCACAAAATTAATTTCTTCTTTGTTTCCTCCACAGGCTATTTTTCATGCAATGCTCATTGTTTAAAGACAAGTTGCATTAGCGGATTCTTTCATTGCTTTTCACCCTGAGTCCTCTCGGGGAGATAGGACAGAATATAAATAAAGTCTAAGTATTATTATTAC 2 1 5' arm Anolis_carolinensis mirnest mir-202 3e-26 gga-mir-202 1e-28 -35.3 .(((((.....((((((((.(((((((((((.(((.(((((((.(((......)))))))))).)))..))))))))))).)))))))).))))).... (-35.3)